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Gene set: IL5_DOWN_BYSTROM (C2:PERT:0061) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Standard name | IL5_DOWN_BYSTROM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Systematic name | C2:PERT:0061 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Brief description | Genes downregulated in mouse bone marrow in response to interleukin-5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Category | C2: Curated | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub-category | PERT: Experimental pertuberation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Full description or Abstract | Interleukin-5 (IL-5) is a hematopoietic differentiation factor that promotes the development of mature eosinophils from progenitors in bone marrow. We present a multifactorial microarray study documenting the transcriptional events in bone marrow of wild-type and IL-5-deficient mice at baseline and in response to infection with Schistosoma mansoni. The microarray data were analyzed by a 4-way subtractive algorithm that eliminated confounding non-IL-5-related sequelae of schistosome infection as well as alterations in gene expression among uninfected mice. Among the most prominent findings, we observed 7- to 40-fold increased expression of transcripts encoding the classic eosinophil granule proteins (eosinophil peroxidase, major basic protein, the ribonucleases) together with arachidonate-15-lipoxygenase and protease inhibitor plasminogen activator inhibitor 2 (PAI-2), in the IL-5-producing, infected wild-type mice only. This was accompanied by increased transcription of genes involved in secretory protein biosynthesis and granule-vesicle formation. Interestingly, we did not detect increased expression of genes encoding eosinophil-related chemokine receptors (CCR1, CCR3) or members of the GATA or CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP) transcription factor families. These data suggest that the IL-5-responsive progenitors in the mouse bone marrow are already significantly committed to the eosinophil lineage and that IL-5 promotes differentiation of these committed progenitors into cells with recognizable and characteristic cytoplasmic granules and granule proteins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Publication URL | 14525773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External links | na | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keywords & MeSH headings | Knockout,Oligonucleotide Array Sequence Analysis,Gene Expression Profiling,P.H.S.,Blood Proteins/genetics,Complementary/genetics,immunology,Hematopoietic Stem Cells,genetics,Genetic,Mice,Hematopoiesis,deficiency,Schistosomiasis mansoni/genetics/immunology,metabolism,Eosinophilia/etiology,DNA,Base Sequence,Transcription,Inbred C57BL,Ribonucleases/genetics,Eosinophil Granule Proteins,Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction,Interleukin-5,cytology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Mouse | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Contributed by | Kate Stafford | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Source platform | Seq_Accession | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Genes | 73 genes, 73 accessions (Toggle view)
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